Tindakan Mahfud MD tersebut mendapatkan dukungan dari banyak pihak, termasuk dari sejumlah tokoh masyarakat dan organisasi yang peduli terhadap isu keamanan.
Mereka menilai bahwa langkah Mahfud MD adalah tindakan yang tepat dan sesuai dengan prinsip negara dalam menangani ancaman keamanan.
Namun, tindakan Mahfud MD juga menuai kontroversi di kalangan sejumlah pihak yang mempertanyakan apakah tindakan ini merupakan solusi yang terbaik untuk mengatasi permasalahan keamanan di Papu
.Beberapa pihak berpendapat bahwa pemerintah seharusnya memberikan ruang untuk dialog dan bernegosiasi dengan kelompok-kelompok yang ingin memperjuangkan hak mereka.
Tindakan Mahfud MD dalam menolak tawaran dialog terkait sandera pilot Susi Air menunjukkan bahwa pemerintah tidak akan berkompromi dengan kelompok bersenjata dan teroris yang mengancam keamanan negara.