2. Flora di Jawa-Bali: Pulau Jawa memiliki variasi iklim yang menciptakan tipe vegetasi yang berbeda. Di Jawa Barat, terdapat hutan hujan tropis dengan pohon jati, sementara ke arah timur, iklim menjadi lebih kering, dan vegetasi sabana tropis mendominasi.
3. Flora di Daerah Peralihan atau Wallacea: Kawasan Wallacea mencakup Sulawesi, Kepulauan Nusa Tenggara, Pulau Timor, dan Kepulauan Maluku. Di sini, iklimnya lebih kering, dan corak vegetasi termasuk sabana tropis, hutan pegunungan, dan berbagai jenis rempah seperti pala dan cengkih.
4. Flora di Papua: Papua memiliki vegetasi hutan hujan tropis tipe Australia Utara yang unik dengan tumbuhan khas seperti eukaliptus. Pegunungan Jaya Wijaya di Papua memiliki vegetasi pegunungan tinggi, sementara di daerah pantai, hutan bakau tumbuh.