Daerah Operasi 6 Yogyakarta secara resmi menjalin kerja sama dengan Stasiun Meteorologi Kelas II Yogyakarta, Badan Meteorologi, Klimatologi, dan Geofisika (BMKG), melalui Penandatanganan Perjanjian Kerja Sama yang dilaksanakan di Yogyakarta pada Senin, 15 Desember 2025. Penandatanganan dilaksanakan oleh Executive Vice President Operasi 6 Yogyakarta, Bambang Respationo dan Kepala Stasiun Meteorologi BMKG Kelas II Yogyakarta, Warjono.
Kerja sama ini bertujuan untuk meningkatkan keselamatan dan keandalan operasional perjalanan kereta api, khususnya melalui dukungan informasi prakiraan cuaca dan peringatan dini cuaca ekstrem yang akurat, cepat, dan terintegrasi. Faktor cuaca memiliki pengaruh signifikan terhadap kelancaran perjalanan kereta api, seperti hujan lebat, angin kencang, maupun kondisi cuaca ekstrem lainnya yang berpotensi mengganggu operasional.
